2011年起,国际研究生院开始在深圳培养海洋相关专业研究生,2019年实现海洋技术与工程项目自主招生并在中科院深海建成联合培养基地,2020年设立海洋能源项目。目前有海洋技术与工程、海洋能源工程等涉海研究生培养项目,每年招收研究生人数超过100名。迄今已有数百名硕士、博士毕业生,以及出站博士后将近20人,为国家以及深圳市的海洋学科发展和海洋产业开发输送了大批优秀人才。